Structures
Membran im festen Zustand ohne H2O-Moleküle
Simulation eines festen/erstarrten Membranbilayers bestehend aus 200 Lipidmolekülen 1-Palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphatidylcholin. Das Modell enthält keine Wassermoleküle.
Heller, H., Schaefer, M., Schulten, K. (1993). Molecular dynamics simulation of a bilayer of 200 lipids in the gel and in the liquid-crystal phases. J. Phys. Chem. 97, 8343-60.
Membran im fluiden Zustand mit H2O-Molekülen
Simulation eines fluiden/flüssigen Membranbilayers bestehend aus 200 Lipidmolekülen 1-Palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphatidylcholin inklusive 5483 Wassermolekülen als Lösungsmittel für die hydrophilen Lipidköpfchen.
Heller, H., Schaefer, M., Schulten, K. (1993). Molecular dynamics simulation of a bilayer of 200 lipids in the gel and in the liquid-crystal phases. J. Phys. Chem. 97, 8343-60.
Membran im fluiden Zustand ohne H2O-Moleküle
Simulation eines fluiden/flüssigen Membranbilayers bestehend aus 200 Lipidmolekülen 1-Palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphatidylcholin. Das Modell enthält keine Wassermoleküle.
Heller, H., Schaefer, M., Schulten, K. (1993). Molecular dynamics simulation of a bilayer of 200 lipids in the gel and in the liquid-crystal phases. J. Phys. Chem. 97, 8343-60.
Psilocyn
Psilocyn ist ein Mykotoxin mit halluzinogener Wirkung und wird von Magic Mushrooms (Psilocybe spp.) erzeugt.
Psilocybin
Psioloybin ist ein Mykotoxin mit halluzinogener Wirkung und wird von Magic Mushrooms (Psilocybe spp.) erzeugt.
Muscimol
Muscimol ist ein Mykotoxin mit halluzinogener Wirkung und wird vom Fliegenpilz (Amanita muscaria) erzeugt.
Ibotensäure
Ibotensäure ist ein Mykotoxin mit halluzinogener Wirkung und wird vom Fliegenpilz (Amanita muscaria) erzeugt.
S-Adenosylmethionin
S-Adenosylmethionin ist im Stoffwechsel an der Übertragung von Methylgruppen (-CH3) beteiligt.
Sulfanilamid
Sulfanilamid ist eine Antibiotikum aus der Gruppe der Sulfonamide und hemmt die bakterielle Folsäurebiosynthese.
Peptidoglykan
Die Struktur ist ein Grundbaustein des Mureins, das den Hauptanteil in der bakteriellen Zellwand ausmacht. Das Molekül besteht aus N-Acetylglukosamin und N-Acetylmuraminsäure, die ein Pentapeptid gebunden hat.
tRNA-Phe
Die dreidimensionale Struktur der tRNA-Moleküle ist L-förmig. Die hier gezeigte tRNA ist spezifisch für die Aminosäure Phenylalanin und stammt von E. coli. Das Molekül hat die Aminosäure noch nicht gebunden.
RNA-Hairpin Modell
Theoretisch berechnete 3D-Struktur eines RNA-Hairpins mit der Sequenz 5'-UAAUCCACGGCCGCCAGUUUGGGCUGGCGGCAUUUU-3' aus der Terminatorregion eines prokaryotischen Gens.
Der Loop im Hairpin besteht aus sechs Nukleotiden, ist jedoch schwer zu identifizieren.
RNA-Polymerase Holoenzym
Das Holoenzym der RNA-Polymerase von E. coli umfasst den Sigma-Faktor sowie das Core-Enzym. Es ist ein kurzlebiger Proteinkomplex, der nur zu Beginn der Transkription in der Promotorsequenz eines Gens auftritt. DNA oder mRNA sind in der gezeigten Struktur nicht enthalten.
Sigma-Faktor mit DNA
Der Sigma-Faktor von E. coli hat spezifisch im Bereich der -35-Sequenz eines Promotors an die DNA gebunden.
RNA-Polymerase Core-Enzym
Core-Enzym der RNA-Polymerase von Escherichia coli ohne DNA und mRNA.
DNA Basenpaar G-C
Die beiden Nukleoside 2'-Desoxyguanosin und 2'-Desoxycytidin sind über drei Wasserstoffbrücken gepaart.
DNA Basenpaar A-T
Die beiden Nukleoside 2'-Desoxyadenosin und 2'-Desoxythymidin sind über zwei Wasserstoffbrücken gepaart.
Uracil
Uracil ist eine Nukleinbase. Sie ist charakteristisch für die RNA und tritt an den Positionen auf, an denen in der DNA ein Thymin vorkommt.
Thymin
Thymin ist eine Nukleinbase und charakteristisch für die DNA. In der RNA tritt an ihrer Stelle Uracil auf.
Lipid A
Lipid A ist Bestandteil der Lipopolysaccharide und verankert diese in der äusseren Membran gramnegativer Bakterien.
Dipicolinsäure
Das Calciumsalz der Dipicolinsäure ist in hoher Konzentration im Zytoplasma bakterieller Endosporen enthalten. Es ersetzt die Wassermoleküle und trägt zur grossen Hitze- und UV-Stabilität der Endosporen bei.
Penicillin G
Penicillin G ist ein Antibiotikum, das hauptsächlich gegen grampositiven Bakterien wirkt. Bei sich aktiv teilenden Zellen verhindert es die Ausbildung der Zellwand. Es hemmt das Enzym Transpeptidase, das die Glycanketten durch kurze Peptidbrücken miteinander verbindet.
Kristallviolett
Der Farbstoff Kristallviolett wird für die Gramfärbung von Bakterien verwendet und bindet selektiv an Teichonsäuren in der grampositiven Zellwand.
Desoxyadenosintriphosphat (dATP)
Desoxyadenosintriphosphat ist eines der vier Nukleotide, die für die DNA-Synthese erforderlich sind.